[1]邓任堂,许红丽,孔桂兴,等.液相芯片技术快速检测2型糖尿病患者相关降糖药物基因多态性的方法学建立[J].现代检验医学杂志,2021,36(02):6-10.[doi:doi:10.3969/j.issn.1671-7414.2021.02.002]
　DENG Ren-tang,XU Hong-li,KONG Gui-xing,et al.Development of A Liquid Phase Chip Technology for Simultaneous and Rapid Detecting of the Gene Polymorphisms in Medications with Type 2 Diabetes Mellitus[J].Journal of Modern Laboratory Medicine,2021,36(02):6-10.[doi:doi:10.3969/j.issn.1671-7414.2021.02.002]
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液相芯片技术快速检测2型糖尿病患者相关降糖药物基因多态性的方法学建立()
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《现代检验医学杂志》[ISSN:/CN:]

卷:
第36卷
期数:
2021年02期
页码:
6-10
栏目:
论　著
出版日期:
2021-04-30

文章信息/Info

Title:
Development of A Liquid Phase Chip Technology for Simultaneous and Rapid Detecting of the Gene Polymorphisms in Medications with Type 2 Diabetes Mellitus
文章编号:
1671-7414（2021）02-006-06
作者:
邓任堂; 许红丽; 孔桂兴; 等
（1.广东省东莞市厚街医院检验科，广东东莞 523945；2.湖南省武冈市人民医院检验科，湖南邵阳 422400）
Author(s):
DENG Ren-tang; XU Hong-li; KONG Gui-xing;  et al
（1.Department of Clinical Laboratory,Dongguan Houjie Hospital, Guangdong Dongguan 523945, China；2.Department of Clinical Laboratory，Hunan Wugang People’s Hospital，Hunan Shaoyang 422400，China）
关键词:
液相芯片; 等位基因特异性引物延伸; 2型糖尿病; 单核苷酸多态性
分类号:
R587.1；Q503
DOI:
doi:10.3969/j.issn.1671-7414.2021.02.002
文献标志码:
A
摘要:
目的　建立一种可同时、快速检测2型糖尿病患者降糖药相关药物基因多态性的液相芯片检测系统。方法　根据7个目的基因的rs号，在Genbank中查找其靶位点附近碱基序列（目的基因包括磺脲类受体1，转录因子7类似物2，胰岛素受体底物1，过氧化物酶体增殖物激活受体γ，有机阳离子转运蛋白与多药和有毒化合物排出家族，有机阴离子转运蛋白家族成员1B1等），以PrimerPlex 软件设计等位基因特异性引物，Primer6.0 软件设计含检测位点的PCR引物，通过多重PCR扩增，等位基因特异性引物延伸（ASPE），MagPlex～Tag 微球杂交，液相芯片系统 Luminex 200检测荧光信号，确定基因型，优化反应体系并以5份代表性标本进行方法学评价。收集2019年1月~12月东莞市厚街医院新诊2型糖尿病患者血液样本115例，采用建立的系统检测上述7个靶位点，并随机选取25例与测序结果比较。结果　7个目标基因经PCR扩增，产物电泳成像后清楚可见7条目标条带，无非特异性条带；经优化ASPE杂交条件，选择退火温度55℃，Biotion～dCTP浓度与dCTP浓度的比值为3∶1，37℃孵育45 min时检测效果最佳；临床样本检测结果显示：纯合子荧光强度中位值（median fluorescence intensity，MFI）比率均>0.9或<0.1，杂合子MFI比率在0.4~0.6之间。纯合子MFI比率批内批间CV在0.9%~3.3%和2.1%~4.6%，而杂合子则在2.9%~7.3%和5.2%~11.2%；DNA最低检测限为0.75ng；25例样本的检测结果与测序结果完全一致，准确度100%。结论　该研究成功建立了一种新的液相芯片检测系统，高效便捷，能同时检测7个目的基因型，满足临床的需求。

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备注/Memo

备注/Memo:
基金项目：东莞市社会科技发展局（重点）项目（201750715023442），东莞市社会科技发展局(一般)项目（201950715023454）。
作者简介：邓任堂（1978-），男，本科，副主任技师，主要研究方向：临床微生物与免疫学检验，E-mail：2804787909@qq.com。
更新日期/Last Update: 2021-04-10